안녕하세요, 내 옆의 물류 파스토입니다. 
온라인 판매를 하다 보면 제품 등록, 주문 관리, 고객 응대만으로도 하루가 빠듯한데요. 여기에 세금계산서 발행과 부가세 신고까지 챙기려면 머리가 복잡해지기 쉽죠. 특히 스마트스토어는 판매자가 직접 세금계산서를 발급하지 않고, 네이버가 기준에 따라 처리하기 때문에 구조를 정확히 이해해야 해요.
이번 글에서는 스마트스토어 세금계산서 발행 방법과 부가세 신고 준비 방법을 정리해드릴게요. 놓치기 쉬운 포인트까지 함께 짚어드리니, 끝까지 확인해보세요.
스마트스토어 세금계산서 발행 방법
출처 네이버 스마트스토어 고객센터
스마트스토어에서 세금계산서는 판매자가 직접 발급하지 않아요. 네이버가 매출 내역을 집계해 일정 기준에 따라 자동으로 발급해요. 이 때문에 발급 시점과 기준을 제대로 이해하고 있어야 신고 과정에서 혼란을 줄일 수 있어요.
•
구매자가 결제할 때 사업자 증빙용 현금영수증을 신청하면, 해당 내역이 세금계산서 발행 대상에 포함돼요.
•
판매자는 별도로 세금계산서를 작성하거나 발급할 필요가 없고, 구매자가 구매확정을 완료한 후 네이버페이 화면에서 조회·출력할 수 있어요.
•
세금계산서는 매월 1일부터 말일까지 발생한 구매확정 건을 기준으로 발행돼요.
•
발행된 세금계산서는 다음 달 3영업일 이내 확인할 수 있어요.
•
‘빠른 정산’을 이용해도 세금계산서 발행 기준일은 동일하게 구매확정일·주문종료일(반품완료일·교환완료일 등)로 적용돼요.
구분 | 기준 | 발행 시점 |
발행 주체 | 네이버 | 판매자가 직접 발행하지 않음 |
발행 기준 | 구매확정일·주문종료일 | 매월 1일~말일 |
발행 시점 | 다음 달 3영업일 이내 | 네이버페이에서 조회 가능 |
세금계산서 발급 품목
출처 네이버 스마트스토어 고객센터
스마트스토어에서 발급되는 세금계산서는 단순히 판매 매출이 아니라, 수수료와 서비스 이용료에 대해 발급돼요. 발행 주체에 따라 네이버파이낸셜과 네이버 주식회사가 구분되며, 각 항목이 달라요. 판매자는 어떤 비용에 대해 세금계산서가 발급되는지 알아두는 게 중요해요.
네이버파이낸셜 세금계산서 발급 품목•
네이버페이 수수료
•
판매수수료 (일반, 탑탑, 원쁠딜 등)
•
버티컬 사용료
•
유입 수수료_공통 (구. 네이버쇼핑 매출 연동 수수료)
•
계약 수수료 (판매자와 별도 계약 시)
•
솔루션 사용료 (별도 커머스솔루션 구매 시)
•
패키지 사용료 (브랜드 솔루션 패키지 등)
•
스마트스토어 무이자 할부 수수료
•
지정반품 택배비 (네이버 지정택배사 수거비)
•
가격비교 수수료 (다나와/에누리 유입 구매 시)
네이버 주식회사 세금계산서 발급 품목•
쇼핑서비스 이용료 (예: 마케팅 메시지 발송 비용)
•
커머스솔루션 서비스 이용료
◦
소비자 조사 솔루션
◦
커스텀 분석 솔루션 (브랜드스토어 특정 판매자 대상 제공)
발행 주체 | 발급 품목 예시 |
네이버파이낸셜 | 네이버페이 수수료, 판매수수료, 버티컬 사용료, 지정반품 택배비 등 |
네이버 주식회사 | 쇼핑서비스(마케팅 메시지), 소비자 조사·분석 솔루션 등 |
부가세 신고 준비
출처 네이버 스마트스토어 고객센터
세금계산서 발행 방법을 알아보았는데요. 이후에 부가세 신고를 정확히 하려면 홈택스만으로는 부족해요. 홈택스에서는 신용카드 매출과 현금영수증 발급 내역은 확인할 수 있지만, 네이버페이 결제 내역은 빠져 있기 때문에 스마트스토어센터 자료를 반드시 함께 확인해야 해요.
•
홈택스에서 확인 가능한 자료는 신용카드 결제분과 현금영수증 발급분이에요.
•
하지만 네이버페이를 통해 결제된 내역은 홈택스에서 조회되지 않으므로, 스마트스토어센터에서 별도로 다운받아야 해요.
•
경로는 정산관리 → 부가세신고 내역 메뉴예요.
◦
조회 결과를 월별로 확인할 수 있고, 엑셀 파일로 다운로드할 수 있어요.
◦
자료에서 [신용카드]와 [현금영수증] 합계 금액은 홈택스 부가세 신고서의 ‘신용카드·현금영수증 발행금액’ 항목에 입력하면 돼요.
◦
[기타] 매출 항목은 ‘정규영수증 외 매출분’에 입력해야 해요.
•
스마트스토어 자료, 홈택스를 함께 확인해야 매출 누락 없이 정확하게 신고할 수 있어요.
항목 | 스마트스토어 내역 | 홈택스 입력란 |
신용카드 | 월별 내역 [신용카드] | 신용카드 발행금액 |
현금영수증 | 월별 내역 [현금영수증] | 현금영수증 발행금액 |
기타 | 월별 내역 [기타] | 정규영수증 외 매출분 |
자주 묻는 질문
출처 네이버 스마트스토어 고객센터
세금계산서 발행 방법과 관련해 스마트스토어 셀러분들이 특히 헷갈려하는 질문들을 정리해봤어요.
•
사업자등록이 없는 개인 판매자도 부가세 신고를 해야 하나요?
◦
개인 판매자의 경우 매출 규모에 따라 부가세 신고 대상이 다를 수 있어요. 반드시 국세청(126)에 문의해 본인의 상황이 신고 대상인지 확인해야 해요.
•
사업자 등록을 하지 않았는데 소득이 발생하면 어떻게 되나요?
◦
사업자 등록을 하지 않은 상태에서 소득이 발생하면 매입세액 공제를 받을 수 없고, 신고를 누락하면 무신고 가산세·미등록 가산세·납부불성실 가산세 등 추가 세금이 부과될 수 있어요.
•
개인 판매자에서 사업자로 전환했을 때 이전 매출은 어떻게 신고하나요?
◦
사업자로 전환하기 전 개인 판매자로서 발생한 매출도 신고 대상일 수 있어요. 이 경우 국세청을 통해 전환 전 매출의 신고 방법을 안내받아야 해요.
•
스마트스토어를 여러 개 운영하는 경우는 어떻게 하나요?
◦
같은 사업자번호로 여러 개의 스마트스토어를 운영한다면, 각 계정에서 발생한 신용카드·현금영수증·기타 매출을 모두 합산해 한 번에 신고해야 해요. 계정별로 따로 신고하면 안 돼요.
상황 | 처리 방법 |
개인 판매자(미등록) | 국세청 문의 후 부가세 신고 대상 여부 확인 |
사업자 등록 안 한 상태에서 매출 발생 | 매입세액 공제 불가, 가산세 발생 위험 |
개인 → 사업자 전환 | 전환 전 매출도 신고 필요, 국세청 안내 필수 |
여러 계정 운영 | 같은 사업자번호 기준 → 매출 합산 후 신고 |
물류 대신, 정산·세무에 더 신경쓰고 싶다면
세금계산서 발행이나 부가세 신고는 판매자가 직접 챙겨야 하는 부분이에요. 다만 운영 과정에서 불필요하게 시간을 많이 쓰지 않으면, 그만큼 여유를 가지고 세무 준비에도 집중할 수 있어요. 물류 관리 시스템을 쓰면 이런 여유가 생겨요.
•
주문 연동 & 자동 출고: 여러 쇼핑몰 주문이 자동으로 모이고 출고까지 이어져요. 매번 수작업으로 정리하는 시간을 크게 줄일 수 있어요.
•
실시간 배송 현황 & 송장번호 자동 등록: 배송 단계가 실시간으로 업데이트돼서 고객 문의 대응이 빨라지고, 불필요한 확인 작업이 줄어들어요.
•
바코드·유통기한 관리: 입·출고부터 재고까지 데이터가 깔끔하게 쌓이니, 운영 기록이 투명해져요.
•
물류비 정산 & 데일리 리포트: 매일 아침 전일 데이터를 리포트로 받아볼 수 있어요. 덕분에 판매 현황을 일일이 따로 집계하지 않아도 돼요.
기능 | 셀러 운영 장점 |
주문 연동·자동 출고 | 수작업 감소, 시간 절약 |
배송 현황·송장 자동등록 | 고객 대응 속도 향상 |
바코드·유통기한 관리 | 오류 줄이고 재고 투명성 확보 |
물류비 정산·데일리 리포트 | 현황 파악이 쉬워 운영 안정성 강화 |
운영 전반이 효율적이면 자연스럽게 여유가 생겨요. 파스토 FMS는 셀러가 더 중요한 일에 시간을 쓸 수 있게 도와줘요. 세금계산서 발행 방법과 부가세 신고, 아직도 혼자 챙기느라 번거로우신가요?
신고 자체는 셀러가 직접 해야 하지만, 운영 데이터가 깔끔하게 쌓여 있으면 준비 과정은 훨씬 가벼워져요. 매출 정리, 재고 확인, 주문 관리에 매번 시간을 쏟고 있다면 이제는 일하는 방식을 바꿔야 할 때예요. 고객에게는 빠르고 정확한 배송 경험을, 셀러 본인은 여유 있는 운영을 만들어주는 파트너가 필요해요.
운영 효율을 높이고 본업에 더 집중하고 싶으시다면?
지금, 파스토에서 시작해보세요.